先天因素包括遗传因素和母亲孕期内外环境的影响。如果母亲在孕2个月到出生阶段，牙齿患有慢性疾病、回事营养不良、小孩稀疏代谢紊乱或生活在有污染的牙齿环境中，就会影响胎儿牙胚的回事形成，其结果就会造成牙齿数目的增多、减少或畸形。
另外，遗传因素也较为重要，如父母牙齿排列不齐，孩子的牙齿排列也可能有类似情况。在出生后到8岁恒牙发育的关键期中，咀嚼功能退化是造成错颌畸形的主要原因之一。现在的孩子食品越来越精细，家长过度关爱，孩子的饮食多为细、软的食物，孩子也越来越不愿意咀嚼粗糙和坚硬的食物，致使咀嚼功能越来越弱，牙齿和咀嚼肌得不到应有的锻炼，导致肌肉无力、萎缩，进而颌骨也不能很好地发育，虽然牙齿的数量并没有减少，但是牙齿错颌畸形的发生率却越来越高。另外由于不注意口腔牙齿的清洁护理造成龋齿生成，严重者造成乳牙下面的继承恒牙受累以至于影响其萌出。如果由于龋齿造成乳牙过早丢失，引起恒牙萌出的间隙不足，就会造成牙齿排列不齐。另外不良的口腔习惯、全身或局部慢性疾病，如佝偻病、慢性鼻炎以及慢性扁桃体炎都会造成错颌畸形。
以上介绍了小孩子牙齿稀疏的原因，但是这也还是可以预防的和治疗的。首先就要注意小孩子的口腔卫生和饮食习惯。最好要吃一些软的、容易消化的食物，不要吃太硬的食物。另外还要做到饭后漱口和早晚刷牙的好习惯。